Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPRD1AQ96P16 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPRD1AQ96P16 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1AQ96P16 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms