Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF578Q96N58 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF578Q96N58 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF578Q96N58 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF578Q96N58 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF578Q96N58 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF578Q96N58 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF578Q96N58 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF578Q96N58 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF578Q96N58 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF578Q96N58 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF578Q96N58 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF578Q96N58 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms