Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNBD2Q96M20 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNBD2Q96M20 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms