Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF479Q96JC4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF479Q96JC4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms