Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZC2HC1AQ96GY0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZC2HC1AQ96GY0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZC2HC1AQ96GY0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms