Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATXN7L3BQ96GX2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATXN7L3BQ96GX2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATXN7L3BQ96GX2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms