Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SH3KBP1Q96B97 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SH3KBP1Q96B97 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3KBP1Q96B97 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3KBP1Q96B97 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms