Protein–RNA interactions for Protein: Q96AP4

ZUFSP, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZUFSPQ96AP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZUFSPQ96AP4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZUFSPQ96AP4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZUFSPQ96AP4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZUFSPQ96AP4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZUFSPQ96AP4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZUFSPQ96AP4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZUFSPQ96AP4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZUFSPQ96AP4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZUFSPQ96AP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZUFSPQ96AP4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZUFSPQ96AP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZUFSPQ96AP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ZUFSPQ96AP4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms