Protein–RNA interactions for Protein: Q969S0

SLC35B4, UDP-xylose and UDP-N-acetylglucosamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35B4Q969S0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC35B4Q969S0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35B4Q969S0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35B4Q969S0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms