Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DDX1Q92499 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX1Q92499 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DDX1Q92499 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DDX1Q92499 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms