Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GPBAR1Q8TDU6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPBAR1Q8TDU6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPBAR1Q8TDU6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms