Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
STAG2Q8N3U4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
STAG2Q8N3U4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
STAG2Q8N3U4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
STAG2Q8N3U4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms