Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5W5

SLC39A4, Zinc transporter ZIP4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A4Q6P5W5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC39A4Q6P5W5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC39A4Q6P5W5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC39A4Q6P5W5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms