Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PMF1Q6P1K2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PMF1Q6P1K2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PMF1Q6P1K2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms