Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAAP20Q6NZ36 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAAP20Q6NZ36 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAAP20Q6NZ36 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAAP20Q6NZ36 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FAAP20Q6NZ36 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms