Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KRT79Q5XKE5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KRT79Q5XKE5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KRT79Q5XKE5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms