Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF20Q5VT98 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF20Q5VT98 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms