Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00242Q5T6M2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC00242Q5T6M2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms