Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
OTUD3Q5T2D3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUD3Q5T2D3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUD3Q5T2D3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms