Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TIMM23BQ5SRD1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TIMM23BQ5SRD1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms