Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PAPPA-AS1Q5QFB9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms