Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTSL3PQ5NE16 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTSL3PQ5NE16 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTSL3PQ5NE16 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms