Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNFAIP8L3Q5GJ75 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNFAIP8L3Q5GJ75 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.8 ms