Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SWI5Q1ZZU3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SWI5Q1ZZU3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SWI5Q1ZZU3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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