Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GEN1Q17RS7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GEN1Q17RS7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GEN1Q17RS7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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