Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTF1Q16619 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTF1Q16619 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTF1Q16619 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CTF1Q16619 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTF1Q16619 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTF1Q16619 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTF1Q16619 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTF1Q16619 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTF1Q16619 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTF1Q16619 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTF1Q16619 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTF1Q16619 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTF1Q16619 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTF1Q16619 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTF1Q16619 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTF1Q16619 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTF1Q16619 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTF1Q16619 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTF1Q16619 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTF1Q16619 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CTF1Q16619 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTF1Q16619 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTF1Q16619 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTF1Q16619 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTF1Q16619 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTF1Q16619 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTF1Q16619 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTF1Q16619 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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