Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME4Q14997 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PSME4Q14997 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PSME4Q14997 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PSME4Q14997 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
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