Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SHROOM2Q13796 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.82
SHROOM2Q13796 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
SHROOM2Q13796 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SHROOM2Q13796 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SHROOM2Q13796 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms