Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CUL1Q13616 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL1Q13616 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CUL1Q13616 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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