Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ERCC8Q13216 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERCC8Q13216 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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ERCC8Q13216 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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ERCC8Q13216 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERCC8Q13216 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERCC8Q13216 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERCC8Q13216 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERCC8Q13216 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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