Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNA1Q09470 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCNA1Q09470 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNA1Q09470 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms