Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLEQ07864 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLEQ07864 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLEQ07864 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLEQ07864 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLEQ07864 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLEQ07864 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLEQ07864 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLEQ07864 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLEQ07864 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLEQ07864 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLEQ07864 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLEQ07864 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLEQ07864 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLEQ07864 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLEQ07864 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLEQ07864 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLEQ07864 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLEQ07864 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLEQ07864 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLEQ07864 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLEQ07864 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLEQ07864 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLEQ07864 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLEQ07864 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLEQ07864 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLEQ07864 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLEQ07864 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLEQ07864 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLEQ07864 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLEQ07864 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLEQ07864 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLEQ07864 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLEQ07864 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLEQ07864 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLEQ07864 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLEQ07864 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLEQ07864 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLEQ07864 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLEQ07864 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLEQ07864 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLEQ07864 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
POLEQ07864 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLEQ07864 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLEQ07864 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLEQ07864 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLEQ07864 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLEQ07864 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLEQ07864 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLEQ07864 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLEQ07864 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLEQ07864 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLEQ07864 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLEQ07864 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLEQ07864 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLEQ07864 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLEQ07864 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLEQ07864 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLEQ07864 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLEQ07864 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLEQ07864 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLEQ07864 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLEQ07864 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLEQ07864 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLEQ07864 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLEQ07864 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLEQ07864 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLEQ07864 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLEQ07864 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLEQ07864 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLEQ07864 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
POLEQ07864 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLEQ07864 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms