Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMX1Q04741 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMX1Q04741 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX1Q04741 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms