Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CREMQ03060 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CREMQ03060 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREMQ03060 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREMQ03060 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREMQ03060 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREMQ03060 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREMQ03060 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREMQ03060 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREMQ03060 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CREMQ03060 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREMQ03060 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREMQ03060 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREMQ03060 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREMQ03060 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CREMQ03060 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREMQ03060 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREMQ03060 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREMQ03060 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREMQ03060 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREMQ03060 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CREMQ03060 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREMQ03060 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREMQ03060 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREMQ03060 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREMQ03060 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREMQ03060 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CREMQ03060 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREMQ03060 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREMQ03060 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREMQ03060 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREMQ03060 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CREMQ03060 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREMQ03060 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREMQ03060 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREMQ03060 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CREMQ03060 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREMQ03060 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREMQ03060 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CREMQ03060 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREMQ03060 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREMQ03060 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREMQ03060 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREMQ03060 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREMQ03060 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREMQ03060 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CREMQ03060 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREMQ03060 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREMQ03060 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREMQ03060 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREMQ03060 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CREMQ03060 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CREMQ03060 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREMQ03060 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREMQ03060 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREMQ03060 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREMQ03060 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREMQ03060 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CREMQ03060 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CREMQ03060 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CREMQ03060 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREMQ03060 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREMQ03060 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREMQ03060 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CREMQ03060 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CREMQ03060 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREMQ03060 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREMQ03060 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREMQ03060 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREMQ03060 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREMQ03060 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREMQ03060 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CREMQ03060 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREMQ03060 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREMQ03060 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREMQ03060 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CREMQ03060 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREMQ03060 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CREMQ03060 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CREMQ03060 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CREMQ03060 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREMQ03060 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREMQ03060 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CREMQ03060 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREMQ03060 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREMQ03060 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CREMQ03060 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CREMQ03060 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREMQ03060 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREMQ03060 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREMQ03060 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREMQ03060 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CREMQ03060 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CREMQ03060 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREMQ03060 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREMQ03060 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CREMQ03060 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREMQ03060 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CREMQ03060 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CREMQ03060 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms