Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD1P98174 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD1P98174 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD1P98174 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD1P98174 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD1P98174 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FGD1P98174 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD1P98174 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD1P98174 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD1P98174 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FGD1P98174 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD1P98174 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD1P98174 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD1P98174 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD1P98174 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD1P98174 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD1P98174 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FGD1P98174 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD1P98174 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD1P98174 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD1P98174 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD1P98174 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD1P98174 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD1P98174 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FGD1P98174 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD1P98174 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FGD1P98174 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD1P98174 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FGD1P98174 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD1P98174 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD1P98174 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD1P98174 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD1P98174 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD1P98174 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD1P98174 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD1P98174 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD1P98174 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FGD1P98174 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD1P98174 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD1P98174 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD1P98174 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD1P98174 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD1P98174 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FGD1P98174 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD1P98174 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD1P98174 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD1P98174 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD1P98174 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD1P98174 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FGD1P98174 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
FGD1P98174 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD1P98174 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD1P98174 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD1P98174 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD1P98174 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD1P98174 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FGD1P98174 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD1P98174 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FGD1P98174 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD1P98174 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD1P98174 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD1P98174 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD1P98174 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD1P98174 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FGD1P98174 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD1P98174 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD1P98174 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FGD1P98174 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD1P98174 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD1P98174 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD1P98174 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD1P98174 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD1P98174 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FGD1P98174 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD1P98174 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD1P98174 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD1P98174 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FGD1P98174 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD1P98174 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD1P98174 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD1P98174 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD1P98174 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FGD1P98174 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD1P98174 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD1P98174 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FGD1P98174 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD1P98174 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD1P98174 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD1P98174 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD1P98174 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FGD1P98174 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD1P98174 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD1P98174 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD1P98174 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD1P98174 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FGD1P98174 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD1P98174 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD1P98174 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD1P98174 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD1P98174 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms