Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB38P57729 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB38P57729 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB38P57729 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB38P57729 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB38P57729 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB38P57729 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB38P57729 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB38P57729 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB38P57729 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB38P57729 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB38P57729 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB38P57729 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB38P57729 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB38P57729 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB38P57729 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB38P57729 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB38P57729 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB38P57729 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB38P57729 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB38P57729 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB38P57729 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB38P57729 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB38P57729 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB38P57729 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB38P57729 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB38P57729 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB38P57729 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB38P57729 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB38P57729 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB38P57729 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB38P57729 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB38P57729 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB38P57729 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB38P57729 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB38P57729 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB38P57729 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB38P57729 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB38P57729 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB38P57729 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB38P57729 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB38P57729 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB38P57729 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB38P57729 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB38P57729 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB38P57729 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB38P57729 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB38P57729 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB38P57729 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB38P57729 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB38P57729 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB38P57729 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB38P57729 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB38P57729 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB38P57729 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB38P57729 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB38P57729 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB38P57729 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB38P57729 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB38P57729 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB38P57729 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB38P57729 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB38P57729 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB38P57729 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB38P57729 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB38P57729 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB38P57729 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB38P57729 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB38P57729 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB38P57729 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB38P57729 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB38P57729 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB38P57729 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB38P57729 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB38P57729 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB38P57729 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB38P57729 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms