Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AIF1P55008 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AIF1P55008 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AIF1P55008 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AIF1P55008 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AIF1P55008 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AIF1P55008 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AIF1P55008 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AIF1P55008 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AIF1P55008 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AIF1P55008 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AIF1P55008 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AIF1P55008 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AIF1P55008 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AIF1P55008 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AIF1P55008 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AIF1P55008 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AIF1P55008 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AIF1P55008 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AIF1P55008 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AIF1P55008 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AIF1P55008 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AIF1P55008 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AIF1P55008 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AIF1P55008 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AIF1P55008 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AIF1P55008 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AIF1P55008 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AIF1P55008 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AIF1P55008 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AIF1P55008 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AIF1P55008 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AIF1P55008 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AIF1P55008 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AIF1P55008 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AIF1P55008 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AIF1P55008 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AIF1P55008 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AIF1P55008 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AIF1P55008 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AIF1P55008 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AIF1P55008 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AIF1P55008 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AIF1P55008 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AIF1P55008 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AIF1P55008 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AIF1P55008 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AIF1P55008 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AIF1P55008 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AIF1P55008 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AIF1P55008 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AIF1P55008 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AIF1P55008 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AIF1P55008 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AIF1P55008 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AIF1P55008 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
AIF1P55008 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AIF1P55008 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AIF1P55008 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AIF1P55008 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AIF1P55008 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AIF1P55008 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AIF1P55008 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AIF1P55008 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AIF1P55008 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AIF1P55008 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AIF1P55008 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AIF1P55008 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AIF1P55008 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AIF1P55008 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AIF1P55008 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AIF1P55008 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AIF1P55008 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AIF1P55008 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AIF1P55008 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AIF1P55008 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AIF1P55008 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AIF1P55008 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AIF1P55008 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AIF1P55008 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AIF1P55008 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AIF1P55008 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AIF1P55008 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AIF1P55008 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AIF1P55008 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AIF1P55008 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AIF1P55008 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AIF1P55008 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AIF1P55008 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AIF1P55008 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AIF1P55008 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AIF1P55008 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AIF1P55008 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AIF1P55008 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AIF1P55008 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AIF1P55008 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AIF1P55008 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AIF1P55008 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AIF1P55008 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AIF1P55008 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms