Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN1P53805 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RCAN1P53805 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCAN1P53805 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms