Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2JP52435 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
POLR2JP52435 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms