Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCP4P48539 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCP4P48539 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCP4P48539 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCP4P48539 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCP4P48539 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCP4P48539 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCP4P48539 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCP4P48539 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCP4P48539 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCP4P48539 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCP4P48539 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCP4P48539 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCP4P48539 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCP4P48539 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCP4P48539 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCP4P48539 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCP4P48539 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCP4P48539 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCP4P48539 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCP4P48539 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCP4P48539 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCP4P48539 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCP4P48539 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCP4P48539 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PCP4P48539 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCP4P48539 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCP4P48539 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCP4P48539 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCP4P48539 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCP4P48539 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCP4P48539 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCP4P48539 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCP4P48539 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCP4P48539 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCP4P48539 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCP4P48539 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCP4P48539 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCP4P48539 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCP4P48539 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCP4P48539 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCP4P48539 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCP4P48539 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCP4P48539 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCP4P48539 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCP4P48539 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCP4P48539 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms