Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA2P48052 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA2P48052 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA2P48052 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA2P48052 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPA2P48052 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA2P48052 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA2P48052 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA2P48052 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA2P48052 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA2P48052 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA2P48052 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA2P48052 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA2P48052 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA2P48052 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA2P48052 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPA2P48052 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA2P48052 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA2P48052 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA2P48052 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA2P48052 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA2P48052 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA2P48052 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CPA2P48052 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA2P48052 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA2P48052 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA2P48052 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPA2P48052 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA2P48052 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA2P48052 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA2P48052 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA2P48052 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA2P48052 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA2P48052 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA2P48052 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA2P48052 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPA2P48052 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA2P48052 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA2P48052 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA2P48052 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA2P48052 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA2P48052 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CPA2P48052 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA2P48052 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA2P48052 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA2P48052 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA2P48052 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPA2P48052 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA2P48052 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA2P48052 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA2P48052 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA2P48052 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA2P48052 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA2P48052 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA2P48052 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPA2P48052 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA2P48052 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA2P48052 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA2P48052 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA2P48052 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA2P48052 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA2P48052 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA2P48052 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA2P48052 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA2P48052 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA2P48052 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPA2P48052 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA2P48052 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA2P48052 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA2P48052 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA2P48052 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA2P48052 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA2P48052 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA2P48052 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA2P48052 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA2P48052 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA2P48052 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA2P48052 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA2P48052 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA2P48052 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA2P48052 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA2P48052 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA2P48052 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA2P48052 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA2P48052 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA2P48052 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA2P48052 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA2P48052 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms