Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA3P42263 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA3P42263 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA3P42263 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA3P42263 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms