Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR7P32248 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR7P32248 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR7P32248 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR7P32248 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR7P32248 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR7P32248 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR7P32248 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR7P32248 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR7P32248 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR7P32248 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR7P32248 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR7P32248 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR7P32248 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR7P32248 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR7P32248 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCR7P32248 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR7P32248 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR7P32248 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR7P32248 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR7P32248 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR7P32248 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR7P32248 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR7P32248 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR7P32248 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR7P32248 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCR7P32248 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR7P32248 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR7P32248 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR7P32248 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR7P32248 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR7P32248 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCR7P32248 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCR7P32248 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCR7P32248 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCR7P32248 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR7P32248 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR7P32248 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCR7P32248 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR7P32248 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR7P32248 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR7P32248 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR7P32248 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCR7P32248 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR7P32248 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR7P32248 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR7P32248 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR7P32248 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR7P32248 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR7P32248 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR7P32248 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR7P32248 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCR7P32248 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR7P32248 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR7P32248 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR7P32248 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR7P32248 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR7P32248 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR7P32248 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR7P32248 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR7P32248 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR7P32248 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCR7P32248 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR7P32248 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR7P32248 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR7P32248 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR7P32248 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR7P32248 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR7P32248 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR7P32248 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCR7P32248 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR7P32248 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR7P32248 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR7P32248 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR7P32248 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR7P32248 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCR7P32248 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR7P32248 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCR7P32248 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR7P32248 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR7P32248 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR7P32248 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR7P32248 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR7P32248 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR7P32248 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCR7P32248 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR7P32248 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR7P32248 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCR7P32248 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR7P32248 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR7P32248 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR7P32248 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR7P32248 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR7P32248 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR7P32248 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCR7P32248 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR7P32248 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR7P32248 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR7P32248 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCR7P32248 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215 ms