Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD34P28906 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD34P28906 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD34P28906 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CD34P28906 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD34P28906 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD34P28906 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD34P28906 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD34P28906 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD34P28906 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CD34P28906 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD34P28906 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CD34P28906 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD34P28906 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD34P28906 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD34P28906 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD34P28906 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CD34P28906 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD34P28906 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD34P28906 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CD34P28906 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD34P28906 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD34P28906 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD34P28906 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD34P28906 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD34P28906 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD34P28906 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD34P28906 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CD34P28906 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD34P28906 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD34P28906 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD34P28906 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD34P28906 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CD34P28906 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD34P28906 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD34P28906 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD34P28906 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD34P28906 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD34P28906 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD34P28906 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD34P28906 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD34P28906 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD34P28906 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD34P28906 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD34P28906 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD34P28906 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD34P28906 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD34P28906 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD34P28906 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD34P28906 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD34P28906 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD34P28906 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD34P28906 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD34P28906 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD34P28906 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD34P28906 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD34P28906 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD34P28906 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD34P28906 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD34P28906 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD34P28906 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD34P28906 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD34P28906 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CD34P28906 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD34P28906 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD34P28906 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD34P28906 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD34P28906 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD34P28906 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD34P28906 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD34P28906 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD34P28906 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD34P28906 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD34P28906 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD34P28906 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms