Protein–RNA interactions for Protein: P25705

ATP5A1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5A1P25705 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5A1P25705 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5A1P25705 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5A1P25705 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP5A1P25705 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP5A1P25705 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP5A1P25705 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP5A1P25705 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP5A1P25705 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP5A1P25705 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms