Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
VAMP1P23763 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VAMP1P23763 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms