Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF1P21675 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF1P21675 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TAF1P21675 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1P21675 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1P21675 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1P21675 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1P21675 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TAF1P21675 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF1P21675 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF1P21675 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TAF1P21675 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1P21675 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1P21675 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1P21675 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1P21675 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1P21675 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TAF1P21675 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TAF1P21675 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TAF1P21675 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TAF1P21675 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1P21675 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1P21675 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1P21675 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1P21675 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1P21675 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1P21675 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1P21675 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TAF1P21675 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1P21675 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1P21675 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1P21675 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1P21675 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1P21675 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1P21675 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1P21675 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1P21675 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TAF1P21675 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1P21675 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1P21675 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1P21675 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1P21675 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1P21675 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1P21675 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1P21675 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TAF1P21675 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1P21675 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1P21675 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1P21675 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1P21675 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1P21675 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1P21675 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1P21675 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1P21675 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TAF1P21675 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TAF1P21675 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TAF1P21675 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TAF1P21675 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1P21675 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1P21675 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1P21675 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TAF1P21675 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF1P21675 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF1P21675 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF1P21675 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TAF1P21675 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1P21675 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1P21675 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1P21675 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1P21675 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1P21675 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1P21675 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1P21675 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TAF1P21675 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1P21675 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1P21675 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1P21675 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1P21675 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1P21675 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1P21675 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TAF1P21675 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF1P21675 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF1P21675 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TAF1P21675 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAF1P21675 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAF1P21675 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TAF1P21675 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TAF1P21675 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1P21675 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1P21675 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1P21675 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TAF1P21675 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1P21675 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1P21675 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1P21675 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1P21675 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1P21675 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TAF1P21675 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1P21675 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TAF1P21675 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms