Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB1P20618 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMB1P20618 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMB1P20618 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB1P20618 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB1P20618 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB1P20618 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB1P20618 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB1P20618 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB1P20618 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB1P20618 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB1P20618 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB1P20618 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB1P20618 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB1P20618 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB1P20618 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB1P20618 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB1P20618 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB1P20618 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB1P20618 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB1P20618 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB1P20618 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB1P20618 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB1P20618 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB1P20618 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB1P20618 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB1P20618 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB1P20618 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB1P20618 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB1P20618 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB1P20618 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMB1P20618 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB1P20618 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB1P20618 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB1P20618 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms