Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CXCL3P19876 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CXCL3P19876 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CXCL3P19876 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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