Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN1P18031 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN1P18031 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN1P18031 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms